醫療制藥廢水處理采用MBR技術凈化水質，MBR技術把活性污泥法與膜分離法相結合，比傳統處理工藝先進很多。MBR技術是制藥廢水創新型工藝技術。MBR技術中生物反應器和膜處理設備，利用廢水濃縮原理把廢水中有毒有害物質分離，工藝中廢水流向也是由內向外的處理方法。

　　
　　浸沒式MBR，也稱一體式MBR，膜組件置于生物反應器內，濾液由泵吸出，設在膜組件下方的曝氣裝置除具有充氧功能外，造成的強烈攪拌作用減輕了混合液中懸浮物在膜表面的吸著。
　　
　　在制藥行業中，MBR具有可使生物處理單元內生物量維持在高濃度，減少生物反應器的占地面積，使一些大分子難降解有機物的停留時間變長，有利于它們的分解;也可采用反沖洗和化學清洗減緩膜通量的下降，從而維持MBR系統的有效使用壽命。
　　
　　專家表示，MBR在制藥廢水處理中有很多優勢，比如，分離效率高，出水水質有保證。制藥廢水中含有大量懸浮物質，通過膜的分離作用，使得出水中懸浮物和濁度接近于零。
　　
　　污泥濃度高，生化能力強。以膜組件代替二沉池，幾乎全部活性污泥均可停留在反應器內，能夠有效地提高污泥濃度。
　　
　　據了解，MBR的污泥濃度可達18000~19000mg/L。專家表示：“與傳統工藝相比，能夠提高污泥濃度，且在發生污泥膨脹后可避免活性污泥流失。”
　　
　　提高了難降解有機物的凈化效率高，縮短了水力停留時間。制藥廢水中的難降解有機物被截留在反應器內，獲得了比傳統生物法過多的與微生物接觸的時間，有利于某些專性微生物的培養，提高難降解有機物的凈化效率。
　　
　　利于硝化細菌生長，NH3-N去除效果好。MBR的膜不能對NH3-N產生截留作用，導致MBR具有較高的NH3-N去除率的主要原因是反應器內存在大量硝化細菌。在膜的分離作用下，生長緩慢的硝化細菌被停留在反應器內，為其生長繁殖創造了有利條件。
　　
　　隨著醫藥工業的發展，制藥廢水已成為重要的污染源之一。而由于制藥廢水成分復雜、有機物含量高、毒性大、色度深、生化性很差，很難處理。MBR處理工藝具有工藝流程簡單、處理效果穩定、管理便利等技術優勢。
　　
　　MBR工藝作為一種新型污水處理工藝，雖然在制藥廢水處理中未得到廣泛的應用，但采用MBR處理工藝技術可以避免傳統工藝處理廢水過程中含有部分殘留的藥物物質，抑制了微生物的生長、繁殖，造成污泥膨脹，終使生化處理失效的現象。
　　

　　另外，MBR工藝也存在膜容易被污染，運行一定時間后要對膜進行反沖洗并隨著運行時間增加，反沖洗的周期不斷縮短;制造成本高，能耗較高。